Los ecosistemas subterráneos son hábitats ocultos en gran parte bajo tierra. El suelo, las redes de raíces, los hongos micorrícicos y las poblaciones microbianas son componentes importantes de los ecosistemas subterráneos. El objetivo de SPUN es destacar el papel crucial que desempeña el subsuelo para sustentar la vida en la superficie. Ejemplos destacados de servicios ecosistémicos prestados por el subsuelo son el ciclo de los nutrientes, la (re)retención del carbono y el almacenamiento y depuración del agua.