La conservación de los hongos es el proceso de reconocimiento, catalogación y defensa de la conservación de los hongos. La catalogación e identificación de hongos puede adoptar la forma de recogida de setas del entorno o secuenciación genética de suelos o muestras de tejidos. La conservación puede implicar la protección del hábitat natural en lugares donde viven los hongos y sus plantas asociadas. También se necesitan marcos, es decir, esfuerzos formales para reconocer e incluir los hongos en las políticas y acuerdos internacionales de conservación. La documentación de los principios globales de conservación de los hongos se convirtió en una prioridad en la Declaración de Córdoba sobre los Hongos de la Tierra de 2007. La catalogación de especies ayuda a los científicos a calcular el número global de especies fúngicas. La estimación actual es de 2-3 millones de especies fúngicas en todo el mundo.